Les frères Vincent et Philippe Prudhon gèrent le domaine familial dans le respect du travail effectué par les générations précédentes. L'entreprise, née après la Seconde Guerre mondiale aux mains du grand-père Henri, est arrivée à la mise en bouteille directe au début des années 1980 sous l'impulsion du père Gérard, se développant petit à petit jusque dans le parc viticole. Aujourd'hui, les Prudhon possèdent plus de 14 hectares de vignes, avec 60% de pinot noir et 40% de chardonnay, répartis entre les appellations Village et Premier Cru sur les communes de Saint-Aubin, Chassagne-Montrachet et Puligny-Montrachet.

Les raisins blancs subissent un pressurage doux et un léger débourbage, pour ensuite finir en barrique pour une fermentation dont la durée varie selon la cuvée. Après une sélection minutieuse et un égrappage, les raisins rouges sont transférés dans des cuves où ils sont laissés se stabiliser pendant quelques jours ; commence ensuite la fermentation, qui dure une dizaine de jours pendant laquelle ont lieu quelques remontages, et le vin finit ensuite en petits fûts, où il repose environ 12 mois.

Les vins de Prudhon sont très représentatifs d'un terroir, celui de Saint-Aubin et de Montrachet, qui s'est imposé dans les chroniques œnologiques pour la grande qualité des vins qui en sont issus.